| Mit Schmalbandfiltern erhält man einen engen Bereich um das Anregungs- oder Emissionmaximum des Farbstoffes und somit eine sehr genaue und spezifische Darstellung der gesuchten Struktur.
Durch den schmalen Wellenlängenbereich, der durchgelassen wird, kann es allerdings passieren, dass das erhaltene Signal nur sehr schwach und kaum wahrnehmbar ist.
In diesen Fällen ist auf Breitbandfilter zurückzugreifen, diese lassen einen weitaus breiteren Wellenlängenbereich passieren, was in einem stärkeren Signal resultiert. Bei einem breiten Bereich des Anregungsfilters besteht die Gefahr, dass auch andere Strukturen als die Gesuchten mit angeregt werden. Ein sehr breiter Sperrfilter hingegen könnte auch Licht passieren lassen, das nicht von der gesuchten Struktur stammt.
Um diese Fehler zu minimieren gibt es für die gängigsten Farbstoffe spezielle Filterkombinationen, mit denen man ein deutliches, aber trotzdem spezifisches Signal erhält.
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