Die Universität Wien gliedert sich im Bereich Forschung in 15 Fakultäten und vier Zentren.
Für die Studienorganisation sind 48 Studienprogrammleitungen und die Studienpräses verantwortlich. 
Im Bereich der Administration gibt es fünf Stabsstellen, elf Dienstleistungseinrichtungen und die besondere Einrichtung Qualitätssicherung.